저 같으면 일단 사유랑 금액부터 확인해볼 것 같습니다~!

거래처가 어떻게 원하는지 (원칙으로 하고 싶은지? 아니면 그냥 장부상 없애고 싶은지)
얼마 되지 않은 금액이면 거래처와의 이야기를 통해 그렇게 마무리 할 수 있겠지만, 큰 경우에는 임의대로 했다가 거래처에서 클레임이 거려올 수도 있을 것 같아요!

거래처가 마이너스 발행하길 원하지 않는다면 시기 상관없이 그냥 아무때나 잡이익 처리해도 세무상 문제없다는 말씀이신건가요 ??

원칙이 아닌 업무처리는 세무상 문제가 없을 수 는 없습니다 ;;
다만 거래처가 올해로 정리하자, 없는 거다라고 했을 때 리스크를 인지했으면 그렇게 하는 것일 뿐이죠

임의 처리를 하는 금액이 크면 클수록 세무적 이슈는 큽니당....

그리고 지금 말하는 게 외상매입금 맞으시죠?
줄돈 아닌데 매입세금계산서 받았고, 공제까지 받았다면, 그런 부분까지도 고려해보셨을까요?

연차가 혹시 낮으시다면 이런 이슈사항 정리 및 관련 리스크를 체크하고 상사나 세무사님이랑 논의하는 것도 좋아요!